MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Enterococcus hirae ATCC 9790 plasmid pTG9790

Total Repeats: 171

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015845	ACC	2	6	1	6	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015845	AAG	2	6	61	66	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015845	AT	3	6	251	256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015845	TTG	2	6	311	316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015845	CTGAAA	2	12	358	369	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015845	GAC	2	6	381	386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015845	TGC	2	6	452	457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015845	CGG	2	6	520	525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015845	AGA	2	6	542	547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015845	AAT	2	6	597	602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015845	TGAAA	2	10	689	698	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015845	ACGT	2	8	722	729	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015845	TTG	2	6	742	747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015845	CTT	2	6	773	778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015845	AGA	2	6	821	826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015845	A	6	6	833	838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015845	AGA	2	6	923	928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015845	TAA	2	6	929	934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015845	TAAT	2	8	964	971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015845	GAAAA	2	10	973	982	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015845	ACCA	2	8	983	990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015845	ATT	2	6	1044	1049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015845	AAG	2	6	1063	1068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015845	GAT	2	6	1170	1175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015845	AGA	2	6	1178	1183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015845	AGA	2	6	1196	1201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015845	GAC	2	6	1277	1282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015845	GAT	2	6	1284	1289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015845	TGG	2	6	1358	1363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015845	GAAA	2	8	1370	1377	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015845	AAT	2	6	1442	1447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015845	GTA	3	9	1482	1490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015845	ACC	2	6	1514	1519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015845	TGA	2	6	2385	2390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015845	GGT	2	6	2969	2974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015845	T	8	8	4329	4336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015845	A	7	7	12244	12250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015845	TA	3	6	12270	12275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015845	AAG	2	6	12278	12283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015845	GTT	2	6	12720	12725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015845	T	6	6	12734	12739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015845	A	6	6	12758	12763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015845	A	6	6	12778	12783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015845	TC	3	6	12820	12825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015845	A	6	6	12852	12857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015845	GT	3	6	12960	12965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015845	A	6	6	12966	12971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015845	GAA	2	6	13008	13013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015845	ATT	2	6	14955	14960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015845	TAG	2	6	16249	16254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015845	CCT	2	6	16258	16263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_015845	TAT	2	6	16283	16288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015845	TAAA	2	8	16303	16310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015845	ATA	2	6	16329	16334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015845	TAT	2	6	16355	16360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015845	GTT	2	6	16375	16380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015845	TAAA	2	8	16410	16417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015845	A	7	7	16415	16421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015845	ATA	2	6	16432	16437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015845	ATA	2	6	16464	16469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015845	ATA	2	6	16496	16501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015845	A	8	8	16512	16519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015845	T	7	7	16536	16542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015845	T	7	7	16552	16558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015845	TAAA	2	8	16566	16573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015845	A	7	7	16571	16577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015845	TAT	2	6	16647	16652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015845	T	6	6	16678	16683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015845	AG	3	6	16690	16695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015845	GTG	2	6	16813	16818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015845	TGC	2	6	16880	16885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015845	TG	3	6	16917	16922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015845	GA	3	6	16938	16943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015845	T	6	6	17017	17022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015845	CTT	2	6	17031	17036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015845	CAA	2	6	17068	17073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015845	T	7	7	17117	17123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015845	AAT	2	6	17152	17157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015845	CAA	2	6	17176	17181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015845	GTA	2	6	17182	17187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015845	T	6	6	17903	17908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015845	T	6	6	17919	17924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015845	AGTTA	2	10	17994	18003	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015845	ACTA	2	8	18051	18058	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015845	AATA	2	8	18059	18066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015845	T	7	7	18106	18112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015845	TACT	2	8	18122	18129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015845	AAG	2	6	18773	18778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015845	AGT	2	6	18799	18804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015845	T	6	6	18806	18811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015845	T	6	6	18832	18837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015845	GCA	2	6	18850	18855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015845	TCGT	2	8	18905	18912	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015845	CTT	2	6	18924	18929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015845	T	6	6	18928	18933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015845	CTT	2	6	18977	18982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015845	TGA	2	6	19176	19181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015845	ATT	2	6	19208	19213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015845	A	8	8	19227	19234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015845	TAT	2	6	19277	19282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015845	TCATTA	2	12	19343	19354	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_015845	TGAT	2	8	19364	19371	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015845	TAT	2	6	19424	19429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015845	TTG	2	6	20092	20097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015845	A	6	6	20136	20141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015845	A	8	8	20179	20186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015845	TTAT	2	8	20187	20194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015845	T	6	6	20250	20255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015845	ATTA	2	8	20271	20278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015845	A	6	6	21303	21308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015845	T	10	10	21313	21322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015845	A	6	6	21324	21329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015845	TGG	2	6	21330	21335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015845	A	7	7	21396	21402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015845	T	7	7	21481	21487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015845	T	8	8	21491	21498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015845	TAA	3	9	21520	21528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015845	ATG	2	6	21537	21542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015845	A	7	7	21567	21573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015845	TGTTA	2	10	21606	21615	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015845	AT	3	6	21616	21621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015845	GCAAA	2	10	21650	21659	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015845	A	11	11	21657	21667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015845	ATT	2	6	21682	21687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015845	GAAG	2	8	21766	21773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015845	ATA	2	6	21875	21880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015845	GAC	2	6	21887	21892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015845	TTC	2	6	21896	21901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015845	T	7	7	21938	21944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015845	T	6	6	22013	22018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015845	T	8	8	22071	22078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015845	TCTT	2	8	22100	22107	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015845	TGT	2	6	22191	22196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015845	TAT	2	6	22242	22247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015845	A	6	6	22292	22297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015845	GAT	2	6	22324	22329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015845	TGAC	2	8	22376	22383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015845	AAAT	2	8	22484	22491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015845	AAT	2	6	23958	23963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015845	TTG	2	6	23994	23999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015845	TAAA	2	8	24009	24016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015845	AGA	2	6	24017	24022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015845	ATT	2	6	24571	24576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015845	TAT	2	6	24706	24711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015845	A	7	7	24730	24736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015845	CCT	2	6	24753	24758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_015845	TGT	2	6	24779	24784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015845	AGA	2	6	24793	24798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015845	TTG	2	6	26271	26276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015845	GTT	2	6	26338	26343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015845	ACG	2	6	26414	26419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_015845	G	6	6	26567	26572	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015845	A	6	6	26583	26588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015845	A	6	6	27907	27912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015845	GTT	2	6	27923	27928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015845	TATTT	2	10	27970	27979	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015845	GATGAA	2	12	27984	27995	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015845	T	7	7	28004	28010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015845	AT	3	6	28029	28034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015845	AGG	2	6	28277	28282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015845	ACA	2	6	28469	28474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_015845	AAG	2	6	28480	28485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015845	TCG	2	6	28487	28492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_015845	ATG	2	6	28493	28498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015845	GTT	2	6	28510	28515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015845	ATA	2	6	28520	28525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015845	CGA	2	6	28526	28531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_015845	T	6	6	28549	28554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_015845	AT	3	6	28560	28565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015845	AC	3	6	28617	28622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
171	NC_015845	GTT	2	6	28672	28677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.